RNS-Virus

Ein RNS-Virus ist ein Virus, das RNS (Ribonukleinsäure) als sein genetisches Material hat. Diese Nukleinsäure ist gewöhnlich einzeln gestrandete RNS (ssRNA), aber kann doppelt gestrandete RNS (dsRNA) sein. Der ICTV klassifiziert RNS-Viren als diejenigen, die der Gruppe III, Gruppe IV oder Gruppe V des Baltimorer Klassifikationssystems gehören, Viren zu klassifizieren, und Viren mit DNA-Zwischengliedern als RNS-Viren nicht denkt. Bemerkenswerte menschliche durch RNS-Viren verursachte Krankheiten schließen SARS, Grippe, Leberentzündung C und Kinderlähmung ein.

Viren mit der RNS als ihr genetisches Material, aber die DNA-Zwischenglieder in ihren Erwiderungszyklus einschließen, werden retroviruses genannt, und umfassen Gruppe VI der Baltimorer Klassifikation. Bemerkenswerte menschliche retroviruses schließen HIV 1 und HIV 2, die Ursache des Krankheits-AIDS ein.

Ein anderer Begriff für RNS-Viren, der ausführlich retroviruses ausschließt, ist ribovirus.

Eigenschaften

Einzeln gestrandete RNS-Viren und RNS-Sinn

RNS-Viren können weiter gemäß dem Sinn oder der Widersprüchlichkeit ihrer RNS in den negativen Sinn und den positiven Sinn oder die ambisense RNS-Viren klassifiziert werden. Viren-RNS des positiven Sinns ist mRNA ähnlich und kann so durch die Gastgeber-Zelle sofort übersetzt werden. Viren-RNS des negativen Sinns ist zu mRNA ergänzend und muss so zur RNS des positiven Sinns durch eine RNS polymerase vor der Übersetzung umgewandelt werden. Als solcher kann die gereinigte RNS eines Virus des positiven Sinns Infektion direkt verursachen, obwohl es weniger ansteckend sein kann als die ganze Virus-Partikel. Die gereinigte RNS eines Virus des negativen Sinns ist allein nicht ansteckend, weil sie in die RNS des positiven Sinns abgeschrieben werden muss, jedoch kann jeder virion zu mehrerem positivem Sinn RNAs abgeschrieben werden. Ambisense RNS-Viren ähneln RNS-Viren des negativen Sinns, außer übersetzen ihnen auch Gene aus dem positiven Ufer.

Doppelt gestrandete RNS-Viren

Die doppelt gestrandeten (ds) RNS-Viren vertreten eine verschiedene Gruppe von Viren, die sich weit in der Gastgeber-Reihe (Menschen, Tiere, Werke, Fungi und Bakterien), Genom-Segment Nummer (ein bis zwölf) und virion Organisation (T-Zahl, capsid Schichten oder Türmchen) ändern. Mitglieder dieser Gruppe schließen den rotaviruses, berühmt allgemein als der häufigste Grund der Gastroenteritis in kleinen Kindern, picobirnaviruses, berühmt weltweit als das meistens vorkommende Virus in fäkalen Proben sowohl von Menschen als auch von Tieren mit oder ohne Zeichen der Diarrhöe ein. Picobirnaviruses, sind auch kürzlich in Atemwege-Proben von Schweinen und bluetongue Virus, einem wirtschaftlich wichtigen pathogen des Viehs und der Schafe berichtet worden. In den letzten Jahren sind bemerkenswerte Fortschritte in der Bestimmung, an atomaren und subnanometeric Niveaus, den Strukturen von mehreren Schlüssel Virenproteine und vom virion capsids von mehreren dsRNA Viren gemacht worden, die bedeutenden Parallelen in der Struktur und den replicative Prozessen von vielen dieser Viren hervorhebend.

Veränderungsraten

RNS-Viren haben allgemein sehr hohe Veränderungsraten im Vergleich zu DNA-Viren, weil Viren-RNS polymerases an der Korrektur lesenden Fähigkeit der DNA polymerases Mangel hat. Das ist ein Grund, warum es schwierig ist, wirksame Impfstoffe zu machen, um durch RNS-Viren verursachte Krankheiten zu verhindern.

Retroviruses haben auch eine hohe Veränderungsrate, wenn auch ihr DNA-Zwischenglied ins Gastgeber-Genom integriert (und so unterworfen ist, um DNA zu veranstalten, die einmal integriert Korrektur liest), weil Fehler während der Rückabschrift in beide Ufer der DNA vor der Integration eingebettet werden.

Einige Gene des RNS-Virus sind für die Virenerwiderungszyklen wichtig, und Veränderungen werden nicht geduldet. Zum Beispiel wird das Gebiet der Leberentzündung C Virus-Genom, das das Kernprotein verschlüsselt, hoch erhalten, weil es eine an einer inneren ribosome Zugang-Seite beteiligte RNS-Struktur enthält.

Erwiderung

Tier-RNS-Viren werden in drei verschiedene Gruppen abhängig von ihrem Genom und Weise der Erwiderung (und die numerischen Gruppen eingeteilt, die auf der älteren Baltimorer Klassifikation gestützt sind):

  • Doppelt gestrandete RNS-Viren (Gruppe III) enthalten von einem bis ein Dutzend verschiedene RNS-Moleküle, von denen jedes für ein oder mehr Virenproteine codiert.
  • Positiver Sinn ssRNA Viren (Gruppe IV) ließ ihr Genom direkt verwerten, als ob es mRNA war, ein einzelnes Protein erzeugend, das vom Gastgeber und den Virenproteinen modifiziert wird, um die verschiedenen für die Erwiderung erforderlichen Proteine zu bilden. Einer von diesen schließt von der RNS abhängige RNS polymerase ein, der die Viren-RNS kopiert, um eine doppelt gestrandete Replicative-Form zu bilden, der Reihe nach leitet das die Bildung von neuem virions.
  • Negativer Sinn ssRNA Viren (Gruppe V) muss ihr Genom durch eine RNS polymerase kopieren lassen, um RNS des positiven Sinns zu bilden. Das bedeutet, dass das Virus zusammen damit die von der RNS abhängige RNS polymerase Enzym bringen muss. Das RNS-Molekül des positiven Sinns handelt dann als Viren-mRNA, der in Proteine vom Gastgeber ribosomes übersetzt wird. Das resultierende Protein setzt fort, die Synthese von neuem virions, wie Capsid-Proteine und RNS replicase zu leiten, der verwendet wird, um neue RNS-Moleküle des negativen Sinns zu erzeugen.

Retroviruses (Gruppe VI) haben ein einzeln gestrandetes RNS-Genom, aber werden allgemein als RNS-Viren nicht betrachtet, weil sie DNA-Zwischenglieder verwenden, um zu wiederholen. Kehren Sie transcriptase um, ein Virenenzym, das aus dem Virus selbst kommt, nachdem es nicht gestrichen ist, wandelt die Viren-RNS in ein Ergänzungsufer der DNA um, die kopiert wird, um ein doppeltes gestrandetes Molekül der Viren-DNA zu erzeugen. Nachdem diese DNA integriert wird, kann der Ausdruck der verschlüsselten Gene die Bildung von neuem virions führen.

Klassifikation

Die Klassifikation der RNS-Viren hat sich erwiesen, ein schwieriges Problem zu sein. Das ist teilweise erwartetes Kleinkind, das die hohe Veränderung abschätzt, erleben diese Genome. Wie man denkt, ist diese hohe Rate der Mangel an einer Probelesen-Funktion in der RNS-Abhängiger-RNS polymerase erwartet. Klassifikation basiert hauptsächlich auf dem Typ des Genoms (doppeltes gestrandetes, negatives oder positives einzelnes Ufer) und Genzahl und Organisation. Es gibt zurzeit 5 Ordnungen und 47 erkannte Familien. Es gibt auch mehrere unbestimmte Arten und Klassen.

Verbunden mit, aber verschieden von den RNS-Viren sind der viroids und die RNS-Satellitenviren. Diese werden als RNS-Viren nicht zurzeit klassifiziert und werden auf ihren eigenen Seiten beschrieben.

Positive Ufer-RNS-Viren

Das ist die einzelne größte Gruppe von RNS-Viren mit 30 Familien. Versuche sind gemacht worden, diese Familien in höheren Ordnungen zu gruppieren. Diese Vorschläge haben auf einer Analyse der RNS polymerases basiert und sind noch unter der Rücksicht. Bis heute, wie man weit gehend akzeptiert hat, haben die vorgeschlagenen Vorschläge wegen Zweifel über die Eignung eines einzelnen Gens die Taxonomie des clade nicht bestimmt.

Die Klassifikation der positiven Ufer-RNS-Viren basiert auf der RNS-Abhängiger-RNS polymerase. Drei Gruppen sind erkannt worden:

I. Bymoviruses, comoviruses, nepoviruses, nodaviruses, picornaviruses, potyviruses, sobemoviruses und eine Teilmenge von luteoviruses (rote Beete Westgelb-Virus und Kartoffel leafroll Virus) - der picorna wie Gruppe (Picornavirata).

II. Carmoviruses, dianthoviruses, flaviviruses, pestiviruses, tombusviruses, einzeln gestrandete RNS bacteriophages, Leberentzündung C Virus und eine Teilmenge von luteoviruses (Gerste gelbes Zwergvirus) - der flavi wie Gruppe (Flavivirata).

III. Alphaviruses, carlaviruses, furoviruses, hordeiviruses, potexviruses, rubiviruses, tobraviruses, tricornaviruses, tymoviruses, Apfel chlorotic Blatt-Punkt-Virus, Rübengelb-Virus und Leberentzündung E Virus - das Alpha wie Gruppe (Rubivirata).

Das Alpha wie Gruppen kann weiter in drei clades geteilt werden: die rubi ähnlichen, tobamo ähnlichen und tymo ähnlichen Viren.

Zusätzliche Arbeit hat fünf Gruppen von positiven gestrandeten RNS-Viren identifiziert, die vier, drei, drei, drei und eine Ordnung (En) beziehungsweise enthalten. Diese vierzehn Ordnungen enthalten 31 Virus-Familien (einschließlich 17 Familien von Pflanzenviren) und 48 Klassen (einschließlich 30 Klassen von Pflanzenviren). Diese Analyse weist darauf hin, dass alphaviruses und flaviviruses in zwei Familien - Togaviridae und Flaviridae beziehungsweise getrennt werden können - aber darauf hinweisen, dass andere taxonomische Anweisungen, wie der pestiviruses, Leberentzündung C Virus, rubiviruses, Leberentzündung E Virus und arteriviruses, falsch sein können. Der coronaviruses und toroviruses scheinen, verschiedene Familien in verschiedenen Ordnungen und nicht verschiedenen Klassen derselben Familie, wie zurzeit klassifiziert, zu sein. Die luteoviruses scheinen, zwei Familien aber nicht ein zu sein, und Apfel chlorotic Blatt-Punkt-Virus scheint, ein closterovirus, aber eine neue Klasse von Potexviridae nicht zu sein.

Doppelte gestrandete RNS-Viren

Diese Analyse weist auch darauf hin, dass die dsRNA Viren nicht nah mit einander verbunden sind, aber stattdessen vier zusätzlichen Klassen - Birnaviridae, Cystoviridae, Partitiviridae und Reoviridae - und einer zusätzlicher Ordnung (Totiviridae) von einer der Klassen von positiven ssRNA Viren in derselben Subunterabteilung wie die positiven Ufer-RNS-Viren gehören.

Gruppe III - dsRNA Viren

Es gibt neun Familien und mehrere unbestimmte Klassen und in dieser Gruppe erkannte Arten.

  • Familie Birnaviridae
  • Familie Chrysoviridae
  • Familie Cystoviridae
  • Familie Endornaviridae
  • Familie Hypoviridae
  • Familie Partitiviridae
  • Familie Picobirnaviridae
  • Familie Reoviridae - schließt Rotavirus ein
  • Familie Totiviridae
  • Unbestimmte Klassen
  • Endornavirus
  • Varicosavirus
  • Unbestimmte Arten
  • Sclerotinia sclerotiorum Schwächungsverbundenes Virus
  • RNS-Virus von Botrytis porri 1

Gruppe IV - positiver Sinn ssRNA Viren

Es gibt drei Ordnungen und 30 in dieser Gruppe erkannte Familien. Außerdem gibt es mehrere nicht klassifizierte Arten und Klassen. Eine neue Familie in der Ordnung Nidovirales - Mesoniviridae - mit einer neuen Klasse - ist Alphamesonivirus - für die Viren vorgeschlagen worden Virus von Cavally und Virus von Nam Dinh sind vorgeschlagen worden und sind erwartete Billigung (oder sonst) durch den ICTV.

  • Bestellen Sie Nidovirales
  • Familie Arteriviridae
  • Familie Coronaviridae - schließt Coronavirus, SARS ein
  • Familie Roniviridae
  • Bestellen Sie Picornavirales
  • Familie Bacillariornaviridae
  • Familie Caliciviridae - schließt Virus von Norwalk ein
  • Familie Dicistroviridae
  • Familie Iflaviridae
  • Familie Labyrnaviridae
  • Familie Marnaviridae
  • Familie Picornaviridae - schließt Poliovirus, das Schnupfen-Virus, die Leberentzündung Ein Virus ein
  • Familie Potyviridae
  • Familie Secoviridae schließt Unterfamilie Comovirinae ein
  • Familie Sequiviridae
  • Bestellen Sie Tymovirales
  • Familie Alphaflexiviridae
  • Familie Betaflexiviridae
  • Familie Gammaflexiviridae
  • Familie Tymoviridae
  • Unbestimmter
  • Familie Alvernaviridae
  • Familie Astroviridae
  • Familie Barnaviridae
  • Familie Bromoviridae
  • Familie Closteroviridae
  • Familie Flaviviridae - schließt Gelbfieber-Virus, Westvirus von Nil, Leberentzündung C Virus, Fieber-Virus von Dengue ein
  • Familie Leviviridae
  • Familie Luteoviridae - schließt Gerste gelbes Zwergvirus ein
  • Familie Narnaviridae
  • Familie Nodaviridae
  • Familie Tetraviridae
  • Familie Togaviridae - schließt Röteln-Virus, Virus von Ross River, Virus von Sindbis, Virus von Chikungunya ein
  • Familie Tombusviridae
  • Familie Virgaviridae
Unbestimmte Klassen
  • Klasse Benyvirus
  • Klasse Hepevirus - schließt Leberentzündung E Virus ein
  • Klasse Idaeovirus
  • Klasse Ourmiavirus
  • Klasse Sobemovirus
  • Klasse Umbravirus
Unbestimmte Arten
  • Eckzahn picodicistrovirus
  • Chronische Biene-Lähmung hat Satellitenvirus vereinigt
  • Kleines Extravirus

Gruppe V - negativer Sinn ssRNA Viren

Es gibt zwei Ordnungen und acht in dieser Gruppe erkannte Familien. Es gibt auch mehrere unbestimmte Arten und Klassen.

  • Bestellen Sie Mononegavirales
  • Familie Bornaviridae - Krankheitsvirus von Borna
  • Familie Filoviridae - schließt Virus von Ebola, Virus von Marburg ein
  • Familie Paramyxoviridae - schließt Masern-Virus, Mumps-Virus, Virus von Nipah, Virus von Hendra ein
  • Familie Rhabdoviridae - schließt Tollwut-Virus ein
  • Unbestimmte Familien:
  • Familie Arenaviridae - schließt Virus von Lassa ein
  • Familie Bunyaviridae - schließt Hantavirus, der Crimean-Kongo hemorrhagic Fieber ein
  • Familie Ophioviridae
  • Familie Orthomyxoviridae - schließt Grippe-Viren ein
  • Unbestimmte Klassen:
  • Klasse Deltavirus
  • Klasse Emaravirus
  • Klasse Nyavirus - schließt Viren von Nyamanini und Midway ein
  • Klasse Tenuivirus
  • Unbestimmte Arten:
  • Virus von Taastrup

Siehe auch

Links

Tierviren

Beschränkungsenzym / Datierung von Radiocarbon
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