In der molekularen Biologie und Genetik ist ein Abschrift-Faktor (hat manchmal einen mit der Folge spezifischen DNA BINDENDEN Faktor genannt), ein Protein, das zu spezifischen DNA-Folgen bindet, dadurch den Fluss (oder Abschrift) von der genetischen Information von der DNA bis mRNA kontrollierend. Abschrift-Faktoren führen diese Funktion allein oder mit anderen Proteinen in einem Komplex, durch die Förderung (als ein Aktivator) oder das Blockieren (als ein repressor) der Einberufung der RNS polymerase durch (das Enzym, das die Abschrift der genetischen Information von der DNA bis RNS durchführt) zu spezifischen Genen.

Eine Definieren-Eigenschaft von Abschrift-Faktoren ist, dass sie ein oder mehr DNA BINDENDE Gebiete (DBDs) enthalten, die spezifischen Folgen der DNA neben den Genen anhaften, die sie regeln. Zusätzliche Proteine wie coactivators, chromatin Wiedermodellierer, histone acetylases, deacetylases, kinases, und methylases, während sie auch entscheidende Rollen in der Genregulierung spielen, haben an DNA BINDENDEN Gebieten Mangel, und werden deshalb als Abschrift-Faktoren nicht klassifiziert.

Bewahrung in verschiedenen Organismen

Abschrift-Faktoren sind für die Regulierung des Genausdrucks notwendig und werden demzufolge in allen lebenden Organismen gefunden. Die Zahl von innerhalb eines Organismus gefundenen Abschrift-Faktoren nimmt mit der Genom-Größe zu, und größere Genome neigen dazu, mehr Abschrift-Faktoren pro Gen zu haben.

Es gibt etwa 2600 Proteine im menschlichen Erbgut, die DNA BINDENDE Gebiete enthalten, und, wie man wagt, die meisten von diesen als Abschrift-Faktoren fungieren. Deshalb codieren etwa 10 % von Genen im Genom für Abschrift-Faktoren, der diese Familie die einzelne größte Familie von menschlichen Proteinen macht. Außerdem werden Gene häufig durch mehrere verbindliche Seiten für verschiedene Abschrift-Faktoren flankiert, und der effiziente Ausdruck von jedem dieser Gene verlangt die kooperative Handlung von mehreren verschiedenen Abschrift-Faktoren (sieh zum Beispiel, hepatocyte Kernfaktoren). Folglich ist der kombinatorische Gebrauch einer Teilmenge der etwa 2000 menschlichen Abschrift-Faktoren leicht für die einzigartige Regulierung jedes Gens im menschlichen Erbgut während der Entwicklung verantwortlich.

Mechanismus

Abschrift-Faktoren binden entweder zum Erweiterer oder zu den Befürworter-Gebieten der DNA neben den Genen, die sie regeln. Abhängig vom Abschrift-Faktor ist die Abschrift des angrenzenden Gens entweder - oder unten geregelt. Abschrift-Faktoren verwenden eine Vielfalt von Mechanismen für die Regulierung des Genausdrucks. Diese Mechanismen schließen ein:

• stabilisieren Sie oder blockieren Sie die Schwergängigkeit der RNS polymerase zur DNA
• katalysieren Sie den acetylation oder deacetylation von histone Proteinen. Der Abschrift-Faktor kann entweder das direkt tun oder andere Proteine mit dieser katalytischen Tätigkeit rekrutieren. Viele Abschrift-Faktoren verwenden ein oder die anderen von zwei gegenüberliegenden Mechanismen, Abschrift zu regeln:
• histone acetyltransferase (HUT) Tätigkeit - acetylates histone Proteine, der die Vereinigung der DNA mit histones schwächt, die die DNA zugänglicher für die Abschrift, dadurch regelnde Abschrift machen
• histone deacetylase (HDAC) Tätigkeit - deacetylates histone Proteine, der die Vereinigung der DNA mit histones stärkt, die die DNA weniger zugänglich für die Abschrift, dadurch unten regelnde Abschrift machen
• rekrutieren Sie coactivator oder corepressor Proteine zum Abschrift-Faktor-DNA-Komplex

Funktion

Abschrift-Faktoren sind eine der Gruppen von Proteinen, die lesen und den genetischen "Entwurf" in der DNA interpretieren. Sie binden zur DNA und helfen, ein Programm der vergrößerten oder verminderten Genabschrift zu beginnen. Als solcher sind sie für viele wichtige Zellprozesse lebenswichtig. Unten sind einige der wichtigen Funktionen, und biologische Rolle-Abschrift-Faktoren werden beteiligt an:

Grundlegende Abschrift-Regulierung

In eukaryotes hat eine wichtige Klasse von Abschrift-Faktoren gerufen allgemeine Abschrift-Faktoren (GTFs) sind für die Abschrift notwendig, um vorzukommen. Viele dieser GTFs binden DNA nicht wirklich, aber sind ein Teil des großen Abschrift-Voreinleitungskomplexes, der mit RNS polymerase direkt aufeinander wirkt. Die allgemeinsten GTFs sind TFIIA, TFIIB, TFIID (sieh auch TATA verbindliches Protein), TFIIE, TFIIF und TFIIH. Der Voreinleitungskomplex bindet zu Befürworter-Gebieten der DNA stromaufwärts zum Gen, das sie regeln.

Differenzialerhöhung der Abschrift

Andere Abschrift-Faktoren regeln unterschiedlich den Ausdruck von verschiedenen Genen durch die Schwergängigkeit zu Erweiterer-Gebieten der DNA neben geregelten Genen. Diese Abschrift-Faktoren sind zum Sicherstellen kritisch, dass Gene in der richtigen Zelle rechtzeitig und im richtigen Betrag abhängig von den sich ändernden Voraussetzungen des Organismus ausgedrückt werden.

Entwicklung

Viele Abschrift-Faktoren in Mehrzellorganismen werden an der Entwicklung beteiligt. Auf Stichwörter (Stimuli) antwortend, drehen diese Abschrift-Faktoren Ein/Aus-die Abschrift der passenden Gene, die abwechselnd Änderungen in der Zellmorphologie oder den Tätigkeiten berücksichtigt, die für den Zellschicksal-Entschluss und die Zellunterscheidung erforderlich sind. Die Hox Abschrift-Faktor-Familie ist zum Beispiel für die richtige Körpermuster-Bildung in Organismen so verschieden wichtig wie Taufliegen Menschen. Ein anderes Beispiel ist der Abschrift-Faktor, der durch das Gen von Sex-determining Region Y (SRY) verschlüsselt ist, das eine Hauptrolle in der Bestimmung des Geschlechtes in Menschen spielt.

Antwort auf Zwischenzellsignale

Zellen können mit einander durch die Ausgabe von Molekülen kommunizieren, die Signalkaskaden innerhalb einer anderen empfänglichen Zelle erzeugen. Wenn das Signal upregulation oder downregulation von Genen in der Empfänger-Zelle verlangt, häufig werden Abschrift-Faktoren in der Signalkaskade abwärts gelegen sein. Oestrogen-Nachrichtenübermittlung ist ein Beispiel einer ziemlich kurzen Signalkaskade, die den Oestrogen-Empfänger-Abschrift-Faktor einschließt: Oestrogen wird durch Gewebe wie die Eierstöcke und Nachgeburt verborgen, durchquert die Zellmembran der Empfänger-Zelle, und wird durch den Oestrogen-Empfänger im Zytoplasma der Zelle gebunden. Der Oestrogen-Empfänger geht dann zum Kern der Zelle und bindet zu seinen DNA BINDENDEN Seiten, die transcriptional Regulierung der verbundenen Gene ändernd.

Antwort auf die Umgebung

Nicht nur führen Abschrift-Faktor-Handlung stromabwärts durch, mit biologischen Stimuli verbundenen Kaskaden Zeichen zu geben, aber sie können auch davon abwärts gelegen sein, an Umweltstimuli beteiligten Kaskaden Zeichen zu geben. Beispiele schließen Hitzestoß-Faktor (HSF) ein, der upregulates Gene, die für das Überleben bei höheren Temperaturen, Hypoxie inducible Faktor (HIF), der upregulates Gene notwendig sind, die für das Zellüberleben in Umgebungen des niedrigen Sauerstoffes und sterol Durchführungselement verbindliche Protein (SREBP) notwendig sind, das hilft, richtige lipid Niveaus in der Zelle aufrechtzuerhalten.

Zellzyklus-Kontrolle

Viele Abschrift-Faktoren besonders regeln einige, die proto-oncogenes oder Geschwulst-Entstörgeräte, Hilfe sind, den Zellzyklus und als solcher bestimmt, wie groß eine Zelle kommen wird, und wenn es sich in zwei Tochter-Zellen teilen kann. Ein Beispiel ist Myc oncogene, der wichtige Rollen im Zellwachstum und apoptosis hat.

Pathogenesis

Abschrift-Faktoren können auch verwendet werden, um Genausdruck in einer Gastgeber-Zelle zu verändern, um pathogenesis zu fördern. Ein gut studiertes Beispiel davon ist der Abschrift-Aktivator wie Effektoren (TAL Effektoren) verborgen von Bakterien von Xanthomonas. Wenn eingespritzt, in Werke können diese Proteine in den Kern der Pflanzenzelle eingehen, Pflanzenbefürworter-Folgen zu binden, und Abschrift von Pflanzengenen zu aktivieren, die in Bakterieninfektion helfen. TAL Effektoren enthalten ein mehrmaliges Hauptgebiet, in dem es eine einfache Beziehung zwischen der Identität von zwei kritischen Rückständen in folgenden Wiederholungen und den folgenden DNA-Basen in der Zielseite des TAL Effektors gibt. Dieses Eigentum macht es wahrscheinlich leichter für diese Proteine sich zu entwickeln, um sich mit den Abwehrmechanismen der Gastgeber-Zelle besser zu bewerben.

Regulierung

Es ist in der Biologie für wichtige Prozesse üblich, vielfache Schichten der Regulierung und Kontrolle zu haben. Das ist auch mit Abschrift-Faktoren wahr: Nicht nur kontrollieren Abschrift-Faktoren die Raten der Abschrift, um die Beträge von Genprodukten (RNS und Protein) verfügbar für die Zelle zu regeln, aber Abschrift-Faktoren selbst werden (häufig durch andere Abschrift-Faktoren) geregelt. Unten ist eine kurze Synopse von einigen der Weisen, wie die Tätigkeit von Abschrift-Faktoren geregelt werden kann:

Synthese

Abschrift-Faktoren (wie alle Proteine) werden von einem Gen auf einem Chromosom in die RNS abgeschrieben, und dann wird die RNS ins Protein übersetzt. Einige dieser Schritte kann geregelt werden, um die Produktion (und so Tätigkeit) eines Abschrift-Faktors zu betreffen. Eine interessante Implikation davon ist, dass Abschrift-Faktoren sich regeln können. Zum Beispiel, in einer negativen Feed-Back-Schleife, handelt der Abschrift-Faktor als sein eigener repressor: Wenn das Abschrift-Faktor-Protein die DNA seines eigenen Gens bindet, wird es unten - die Produktion von mehr von sich regeln. Das ist ein Mechanismus, niedrige Stufen eines Abschrift-Faktors in einer Zelle aufrechtzuerhalten.

Kernlokalisierung

In eukaryotes werden Abschrift-Faktoren (wie die meisten Proteine) im Kern abgeschrieben, aber werden dann im Zytoplasma der Zelle übersetzt. Viele Proteine, die im Kern aktiv sind, enthalten Kernlokalisierungssignale dass direkt sie zum Kern. Aber, für viele Abschrift-Faktoren, ist das ein Stichpunkt in ihrer Regulierung. Wichtige Klassen von Abschrift-Faktoren wie einige Kernempfänger müssen zuerst einen ligand binden, während im Zytoplasma, bevor sie zum Kern umziehen können.

Aktivierung

Abschrift-Faktoren können aktiviert (oder ausgeschaltet werden) durch ihr signalfühlendes Gebiet durch mehrere Mechanismen einschließlich:

• ligand, der - Nicht nur bindet, ist ligand Schwergängigkeit, die fähig ist zu beeinflussen, wo ein Abschrift-Faktor innerhalb einer Zelle gelegen wird, aber Ligand-Schwergängigkeit kann auch betreffen, ob der Abschrift-Faktor in einem aktiven staatlichen und fähiger von der verbindlichen DNA oder anderem cofactors ist (sieh zum Beispiel, Kernempfänger).
• phosphorylation - Viele Abschrift-Faktoren wie STAT-Proteine müssen phosphorylated sein, bevor sie DNA binden können.
• Wechselwirkung mit anderen Abschrift-Faktoren (z.B, homo- oder Hetero-dimerization) oder coregulatory Proteine

Zugänglichkeit der DNA BINDENDEN Seite

In eukaryotes wird die DNA mit der Hilfe von histones in den Kompaktpartikeln organisiert, der nucleosomes, wo ungefähr 147 DNA-Grundpaare zwei machen, dreht das histone Protein octamer um. Die DNA innerhalb von nucleosomes ist zu vielen Abschrift-Faktoren unzugänglich. Einige Abschrift-Faktoren, so genannte Pionierfaktoren sind noch im Stande, ihre DNA verbindliche Seiten auf der nucleosomal DNA zu binden. Für die meisten anderer Abschrift-Faktoren sollte der nucleosome durch molekulare Motoren wie Chromatin-Wiedermodellierer aktiv entfernt werden. Wechselweise kann der nucleosome durch Thermalschwankungen teilweise ausgewickelt werden, die vorläufigen Zugang zum Abschrift-Faktor verbindliche Seite erlauben. In vielen Fällen muss sich ein Abschrift-Faktor darum bewerben, zu seiner DNA verbindliche Seite mit anderen Abschrift-Faktoren und histones oder non-histone chromatin Proteine zu binden. Paare von Abschrift-Faktoren und anderen Proteinen können gegnerische Rollen (Aktivator gegen repressor) in der Regulierung desselben Gens spielen.

Verfügbarkeit anderer cofactors/transcription Faktoren

Die meisten Abschrift-Faktoren arbeiten allein nicht. Häufig, für die Genabschrift, um vorzukommen, müssen mehrere Abschrift-Faktoren zur DNA Durchführungsfolgen binden. Diese Sammlung von Abschrift-Faktoren rekrutiert abwechselnd intermediäre Proteine wie cofactors, die effiziente Einberufung des Voreinleitungskomplexes und der RNS polymerase erlauben. So, für einen einzelnen Abschrift-Faktor, um Abschrift zu beginnen, müssen alle diese anderen Proteine auch da sein, und der Abschrift-Faktor muss in einem Staat sein, wo es zu ihnen nötigenfalls binden kann.

Struktur

Abschrift-Faktoren sind in der Struktur modular und enthalten die folgenden Gebiete:

• DNA bindendes Gebiet (DBD), die spezifischen Folgen der DNA anhaften (Erweiterer oder Befürworter: Notwendiger Bestandteil für alle Vektoren: verwendet, um Abschrift der transgene Befürworter-Folgen des Vektoren zu steuern), neben geregelten Genen. DNA-Folgen, die Abschrift-Faktoren binden, werden häufig Ansprechelemente genannt.
• Trans-Aktivieren des Gebiets (TAD), die verbindliche Seiten für andere Proteine wie Abschrift coregulators enthalten. Diese verbindlichen Seiten werden oft Aktivierungsfunktionen (AFs) genannt.

• Ein fakultatives Signalabfragungsgebiet (SSD) (z.B, ein ligand verbindliches Gebiet), auf den Sinne Außensignale und als Antwort diese Signale zum Rest des Abschrift-Komplexes übersenden, - oder Unten-Regulierung des Genausdrucks hinauslaufend. Außerdem können der DBD und die signalfühlenden Gebiete auf getrennten Proteinen wohnen, die innerhalb des Abschrift-Komplexes verkehren, um Genausdruck zu regeln.

Das Trans-Aktivieren des Gebiets

Das Trans-Aktivieren von Gebieten (TADs) wird nach ihrer Aminosäure-Zusammensetzung genannt. Diese Aminosäuren sind für die Tätigkeit entweder notwendig oder einfach im TAD am reichlichsten. Transactivation durch den Gal4 Abschrift-Faktor wird durch acidic Aminosäuren vermittelt, wohingegen hydrophobe Rückstände in Gcn4 eine ähnliche Rolle spielen. Folglich werden die TADs in Gal4 und Gcn4 acidic oder hydrophobe Aktivierungsgebiete beziehungsweise genannt.

Neun Aminosäure transactivation Gebiet (9aaTAD) definiert ein neuartiges Gebiet, das für eine große Superfamilie von eukaryotic Abschrift-Faktoren üblich ist, die durch Gal4, Oaf1, Leu3, Rtg3, Pho4, Gln3, Gcn4 in der Hefe und durch p53, NFAT, NF-κB und VP16 in Säugetieren vertreten sind. Vorhersage für 9aa TADs (sowohl für acidic als auch für wasserquellfähige transactivation Gebiete) ist online von ExPASy und dem EMBnet Spanien verfügbar

9aaTAD wirken Abschrift-Faktoren p53, VP16, MLL, E2A, HSF1, NF-IL6, NFAT1 und NF-κB direkt mit dem allgemeinen coactivators TAF9 und CBP/p300 aufeinander. p53 9aaTADs wirken mit TAF9, GCN5 und mit vielfachen Gebieten von CBP/p300 (KIX, TAZ1, TAZ2 und IBiD) aufeinander.

Das KIX Gebiet von allgemeinem coactivators Med15 (Gal11) wirkt 9aaTAD Abschrift-Faktoren Gal4, Pdr1, Oaf1, Gcn4, VP16, Pho4, Msn2, Ino2 und P201 aufeinander. Wechselwirkungen von Gal4, Pdr1 und Gcn4 mit Taf9 wurden berichtet. 9aaTAD ist vielfacher allgemeiner coactivators von Rekruten eines allgemeinen transactivation Gebiets TAF9, MED15, CBP/p300 und GCN5.

DNA BINDENDES Gebiet

Der Teil (Gebiet) des Abschrift-Faktors, der DNA bindet, wird sein DNA BINDENDES Gebiet genannt. Unten ist eine teilweise Liste von einigen der Hauptfamilien von DNA BINDENDEN Faktoren der Gebiete/Abschrift:

Ansprechelemente

Die DNA-Folge, zu der ein Abschrift-Faktor bindet, wird eine Abschrift-Seite der Faktor-Schwergängigkeit oder Ansprechelement genannt.

Abschrift-Faktoren wirken mit ihren verbindlichen Seiten mit einer Kombination von elektrostatischen aufeinander (von denen Wasserstoffobligationen ein spezieller Fall sind), und Kräfte von Van der Waals. Wegen der Natur dieser chemischen Wechselwirkungen binden die meisten Abschrift-Faktoren DNA in einer Folge spezifische Weise. Jedoch können nicht alle Basen in der Abschrift-Seite der Faktor-Schwergängigkeit wirklich mit dem Abschrift-Faktor aufeinander wirken. Außerdem können einige dieser Wechselwirkungen schwächer sein als andere. So binden Abschrift-Faktoren gerade eine Folge nicht, aber sind dazu fähig, eine Teilmenge nah zusammenhängender Folgen, jedes mit einer verschiedenen Kraft der Wechselwirkung zu binden.

Zum Beispiel, obwohl die Einigkeit die verbindliche Seite für das TATA-verbindliche Protein (TBP) ist TATAAAA, der TBP Abschrift-Faktor, auch ähnliche Folgen wie TATATAT oder TATATAA binden kann.

Weil Abschrift-Faktoren eine Reihe zusammenhängender Folgen binden können und diese Folgen dazu neigen, kurzer, potenzieller Abschrift-Faktor zu sein, können verbindliche Seiten zufällig vorkommen, wenn die DNA-Folge lang genug ist. Es ist jedoch unwahrscheinlich, dass ein Abschrift-Faktor alle vereinbaren Folgen im Genom der Zelle bindet. Andere Einschränkungen, wie DNA-Zugänglichkeit in der Zelle oder Verfügbarkeit von cofactors können auch helfen zu diktieren, wo ein Abschrift-Faktor wirklich binden wird. So in Anbetracht der Genom-Folge ist es noch schwierig vorauszusagen, wo ein Abschrift-Faktor wirklich in einer lebenden Zelle binden wird.

Zusätzliche Anerkennungsgenauigkeit kann jedoch durch den Gebrauch von mehr als einem DNA BINDENDEM Gebiet erhalten werden (zum Beispiel Tandem DBDs in demselben Abschrift-Faktor oder durch dimerization von zwei Abschrift-Faktoren), die zu zwei oder mehr angrenzenden Folgen der DNA binden.

Klinische Bedeutung

Abschrift-Faktoren sind von der klinischen Bedeutung aus mindestens zwei Gründen: (1) können Veränderungen mit spezifischen Krankheiten vereinigt werden, und (2) können sie Ziele von Medikamenten sein.

Unordnungen

Wegen ihrer wichtigen Rollen in der Entwicklung, der Zwischenzellnachrichtenübermittlung und dem Zellzyklus, sind einige menschliche Krankheiten mit Veränderungen in Abschrift-Faktoren vereinigt worden.

Viele Abschrift-Faktoren sind entweder Geschwulst-Entstörgeräte oder oncogenes, und so, Veränderungen oder abweichende Regulierung von ihnen wird mit Krebs vereinigt. Wie man bekannt, sind drei Gruppen von Abschrift-Faktoren in menschlichem Krebs wichtig: (1) der NF-kappaB und AP 1 Familien, (2) die STAT Familie und (3) die Steroide-Empfänger.

Unten sind einige der mehr gut studierten Beispiele:

Potenzielle Rauschgift-Ziele

Etwa 10 % zurzeit vorgeschriebener Rauschgifte nehmen direkt die Kernempfänger-Klasse von Abschrift-Faktoren ins Visier. Beispiele schließen tamoxifen und bicalutamide für die Behandlung des Brust- und Vorsteherdrüse-Krebses, beziehungsweise, und verschiedene Typen von antientzündlichen und Anaboliken ein. Außerdem werden Abschrift-Faktoren häufig durch Rauschgifte durch die Nachrichtenübermittlung Kaskaden indirekt abgestimmt. Es könnte möglich sein, andere weniger erforschte Abschrift-Faktoren wie NF-κB mit Rauschgiften direkt ins Visier zu nehmen. Wie man denkt, sind Abschrift-Faktoren außerhalb der Kernempfänger-Familie schwieriger, mit kleiner Molekül-Therapeutik ins Visier zu nehmen, da es nicht klar ist, dass sie "drugable" sind, aber Fortschritte sind auf dem Kerbe-Pfad gemacht worden.

Analyse

Es gibt verschiedene Technologien, die verfügbar sind, um Abschrift-Faktoren zu analysieren. Auf dem genomic Niveau werden DNA-SEQUENCING und Datenbankforschung allgemein verwendet. Die Protein-Version des Abschrift-Faktors ist durch das Verwenden spezifischer Antikörper feststellbar. Die Probe wird auf einem Westklecks entdeckt. Durch das Verwenden der Electrophoretic-Beweglichkeit wechselt Feinprobe aus (EMSA) kann das Aktivierungsprofil von Abschrift-Faktoren entdeckt werden. Eine Mehrfachannäherung für die Kopierfräs-Aktivierung ist ein TF Span-System, wo mehrere von verschiedenen Abschrift-Faktoren in der Parallele entdeckt werden können. Diese Technologie basiert auf der DNA-Mikroreihe, die spezifische DNA BINDENDE Folge für das Abschrift-Faktor-Protein auf der Reihe-Oberfläche zur Verfügung stellend.

Klassen

Wie beschrieben, ausführlicher unten können Abschrift-Faktoren durch ihren (1) Mechanismus der Handlung, (2) Durchführungsfunktion, oder (3) Folge-Homologie (und folglich Strukturähnlichkeit) in ihren DNA BINDENDEN Gebieten klassifiziert werden.

Mechanistisch

Es gibt drei mechanistische Klassen von Abschrift-Faktoren:

• Allgemeine Abschrift-Faktoren werden an der Bildung eines Voreinleitungskomplexes beteiligt. Die allgemeinsten werden als TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF und TFIIH abgekürzt. Sie sind allgegenwärtig und wirken mit dem Kernbefürworter-Gebiet aufeinander, das die Abschrift-Anfang-Seite (N) aller Gene der Klasse II umgibt.
• Stromaufwärts sind Abschrift-Faktoren Proteine, die irgendwo stromaufwärts der Einleitungsseite binden, um Abschrift zu stimulieren oder zu unterdrücken. Diese sind mit spezifischen Abschrift-Faktoren grob synonymisch, weil sie sich beträchtlich abhängig davon ändern, welche Anerkennungsfolgen in der Nähe des Gens da sind.

Funktionell

Abschrift-Faktoren sind gemäß ihrer Durchführungsfunktion klassifiziert worden:

• I. bestimmend aktiv - präsentieren in allen Zellen zu jeder Zeit - allgemeine Abschrift-Faktoren, Sp1, NF1, CCAAT
• II. bedingt aktiv - verlangt Aktivierung
• II.A Entwicklungs-(Zelle spezifisch) - Ausdruck wird dicht kontrolliert, aber, einmal ausgedrückt, verlangen Sie keine zusätzliche Aktivierung - GATA, HNF, GRUBE 1, MyoD, Myf5, Hox, Geflügelte Spirale
• II.B Signalabhängiger - verlangt Außensignal für die Aktivierung
• II.B.1 extracellular ligand (endokrin oder paracrine) - Abhängiger - Kernempfänger
• II.B.2 intrazellulärer ligand (autocrine) - Abhängiger - aktiviert durch kleine intrazelluläre Moleküle - SREBP, p53, Waise Kernempfänger
• II.B.3 Zellmembranenempfänger-Abhängiger - der zweite Bote, der Kaskaden Zeichen gibt, die auf den phosphorylation des Abschrift-Faktors hinauslaufen
• II.B.3.a Residentkernfaktoren - wohnen im Kern unabhängig vom Aktivierungsstaat - CREB, AP 1, Mef2
• II.B.3.b latente cytoplasmic Faktoren - untätige Form wohnt im Zytoplasma, aber, wenn aktiviert, wird in den Kern - STAT, R-SMAD, NF-κB, Kerbe, FASSARTIG, NFAT verlagert

Strukturell

Abschrift-Faktoren werden häufig gestützt auf der Folge-Ähnlichkeit und folglich der tertiären Struktur ihrer DNA BINDENDEN Gebiete klassifiziert:

• 1 Superklasse: Grundlegende Gebiete
• 1.1 Klasse: Reißverschluss-Faktoren von Leucine (bZIP)
• 1.1.1 Familie: AP 1 (artige) Bestandteile; schließt (c-Fos/c-Jun) ein
• 1.1.2 Familie: CREB
• 1.1.3 Familie: C/EBP-like Faktoren
• 1.1.4 Familie: bZIP / DURCHSCHNITT
• 1.1.5 Familie: PflanzenG-Kasten verbindliche Faktoren
• 1.1.6 Familie: SCHWIRREN nur
• 1.2 Klasse: Faktoren der Schleife-Spirale der Spirale (bHLH)
• 1.2.1 Familie: Allgegenwärtig (Klasse A) Faktoren
• 1.2.2 Familie: Abschrift-Faktoren von Myogenic (MyoD)
• 1.2.3 Familie: Achaete-Scute
• 1.2.4 Familie: Tal/Twist/Atonal/Hen
• 1.3 Klasse: Schleife-Spirale der Spirale / leucine Reißverschluss-Faktoren (BHLH-SCHWIRREN)
• 1.3.1 Familie: Allgegenwärtige BHLH-SCHWIRREN-Faktoren; schließt USF (USF1, USF2) ein; SREBP (SREBP)
• 1.3.2 Familie: Zellzyklus-Steuern-Faktoren; schließt c-Myc ein
• 1.4 Klasse: NF-1
• 1.4.1 Familie: NF-1 (A, B, C, X)
• 1.5 Klasse: RF-X
• 1.5.1 Familie: RF-X (1, 2, 3, 4, 5, ANK)
• 1.6 Klasse: bHSH
• 2 Superklasse: Zinkkoordinierende DNA BINDENDE Gebiete
• 2.1 Klasse: Cys4 Zinkfinger des Kernempfänger-Typs
• 2.1.1 Familie: Steroide-Hormonempfänger
• 2.1.2 Familie: Schilddrüse-Hormon einem Empfänger ähnliche Faktoren
• 2.2 Klasse: verschiedene Cys4 Zinkfinger
• 2.2.1 Familie: GATA-Faktoren
• 2.3 Klasse: Cys2His2 Zinkfinger-Gebiet
• 2.3.1 Familie: Allgegenwärtige Faktoren, schließt TFIIIA, Sp1 ein
• 2.3.2 Familie: Entwicklungs-/Zellzyklus-Gangregler; schließt Krüppel ein
• 2.3.4 Familie: Große Faktoren mit NF-6B-like verbindliche Eigenschaften
• 2.4 Klasse: Cys6 Cysteine-Zinktraube
• 2.5 Klasse: Zinkfinger der Wechselzusammensetzung
• 3 Superklasse: Spirale-Umdrehungsspirale
• 3.1 Klasse: Gebiet von Homeo
• 3.1.1 Familie: Gebiet von Homeo nur; schließt Ubx ein
• 3.1.2 Familie: POU Bereichsfaktoren; schließt Okt ein
• 3.1.3 Familie: Gebiet von Homeo mit dem LIM Gebiet
• 3.1.4 Familie: Homeo-Gebiet plus Zinkfinger-Motive
• 3.2 Klasse: Paarweise angeordneter Kasten
• 3.2.1 Familie: Paarweise angeordnet plus das homeo Gebiet
• 3.2.2 Familie: Paarweise angeordnetes Gebiet nur
• 3.3 Klasse: Gabel-Kopf / geflügelte Spirale
• 3.3.1 Familie: Entwicklungsgangregler; schließt forkhead ein
• 3.3.2 Familie: Gewebespezifische Gangregler
• 3.3.3 Familie: Zellzyklus-Steuern-Faktoren
• 3.3.0 Familie: Andere Gangregler
• 3.4 Klasse: Hitzestoß-Faktoren
• 3.4.1 Familie: HSF
• 3.5 Klasse: Trauben von Tryptophan
• 3.5.1 Familie: Myb
• 3.5.2 Familie: Ets-Typ
• 3.5.3 Familie: Interferon Durchführungsfaktoren
• 3.6 Klasse: TEE (transcriptional Erweiterer-Faktor) Gebiet
• 3.6.1 Familie: TEE (TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4)
• 4 Superklasse: Faktoren des Beta-Schafotts mit Geringen Rinne-Kontakten
• 4.1 Klasse: RHR (Homologie-Gebiet von Rel)
• 4.1.1 Familie: Rel/ankyrin; NF-kappaB
• 4.1.2 Familie: ankyrin nur
• 4.1.3 Familie: NFAT (Kernfaktor von Aktivierten T-Zellen) (NFATC1, NFATC2, NFATC3)
• 4.2 Klasse: STAT
• 4.2.1 Familie: STAT
• 4.3 Klasse: p53
• 4.3.1 Familie: p53
• 4.4 Klasse: MADS Kasten
• 4.4.1 Familie: Gangregler der Unterscheidung; schließt (Mef2) ein
• 4.4.2 Familie: Antwortsender zu Außensignalen, SRF (Serum-Ansprechfaktor)
• 4.4.3 Familie: Metabolische Gangregler (ARG80)
• 4.5 Klasse: Abschrift-Faktoren der Alpha-Spirale des Beta-Barrels
• 4.6 Klasse: TATA verbindliche Proteine
• 4.6.1 Familie: TBP
• 4.7 Klasse: HMG-Kasten
• 4.7.1 Familie: SOCKEN-Gene, SRY
• 4.7.2 Familie: TCF-1 (TCF1)
• 4.7.3 Familie: HMG2-zusammenhängend, SSRP1
• 4.7.5 Familie: MATA
• 4.8 Klasse: Heteromeric CCAAT Faktoren
• 4.8.1 Familie: Heteromeric CCAAT Faktoren
• 4.9 Klasse: Grainyhead
• 4.9.1 Familie: Grainyhead
• 4.10 Klasse: Bereichsfaktoren des kalten Stoßes
• 4.10.1 Familie: csd
• 4.11 Klasse: Zwergrind
• 4.11.1 Familie: Zwergrind
• 0 Superklasse: Andere Abschrift-Faktoren
• 0.1 Klasse: Kupferfaust-Proteine
• 0.2 Klasse: HMGI (Y) (HMGA1)
• 0.2.1 Familie: HMGI (Y)
• 0.3 Klasse: Taschengebiet
• 0.4 Klasse: E1A ähnliche Faktoren
• 0.5 Klasse: AP2/EREBP-related Faktoren
• 0.5.1 Familie: AP2
• 0.5.2 Familie: EREBP
• 0.5.3 Superfamilie: AP2/B3
• 0.5.3.1 Familie: ARF
• 0.5.3.2 Familie: ABI
• 0.5.3.3 Familie: RAV

Siehe auch

• DNA BINDENDES Protein
• Hemmstoff des DNA BINDENDEN Proteins
• Kernempfänger, eine Klasse von ligand hat Abschrift-Faktoren aktiviert
• Phylogenetic footprinting
• Protein-Familie von Cdx
• TRANSFAC Datenbank

Links

• Schwergängigkeit der Protein-DNA: Daten, Werkzeuge & Modelle

• Abbildung 8-10 von der Wesentlichen Zellbiologie.